马新云出身于儒医世家， 14 岁跟随祖父学医，在临床上对儿科的常见病、多发病以及各种疑难重症，如小儿急性肾炎、肾病、哮喘、肺炎、病毒性心肌炎采用中医理论辩证施治，疗效显著。他不仅著书立说，撰写了极具价值的学术论文数十篇，还重视科研工作，由他主持应用微机辅助中医诊断“小儿肺炎”、“小儿感冒兼证、辩证”临床施治内容的电子软件获得省卫生厅科研成果一等奖、科委三等奖，主持小儿厌食症的科研课题获省卫生厅科学进步二等奖。马新云先后执教于天津中医学院、河北中医学院，培养学生数千名，可谓桃李满天下，被国家两部一局确定为全国首批 500 名国家级名老中医药专家、学术继承人的导师，培桃栽李、不辍耕耘。